Du 12e au 14e siècle, Biervliet était une ville d'importance. La prospérité de la ville était le fruit de l'industrie florissante du sel qui parvenait à extraire du sel de la tourbe. Vers 1400, presque toute la tourbe de la région avait été exploitée et la ville commença à connaître un déclin économique. À cette époque, la ville subit d'importantes inondations et se retrouva isolée sur une île. Au début de la Guerre de Quatre-Vingts ans, la ville comme l'île sur laquelle elle se trouvait avaient considérablement réduit de taille.
Au début des années 1580, Alexandre Farnèse, qui deviendra duc de Parme, mena une campagne en Flandre en vue de reprendre cette région pour la couronne d'Espagne. En 1583, il s'empara du Pays de Waas. En réponse à cela, les troupes des Staatsen, sous le commandement de Philippe, comte de Hohenlohe, occupèrent la ville portuaire de Ter Neuzen et la ville de Biervliet.
En 1592-1593, les Staatsen érigèrent une fortification à l'intérieur de l'enceinte de l'ancienne ville. Il s'agissait d'un fort hexagonal avec des remparts en terre, doté d'un bastion à chaque coin et entouré d'un fossé avec contre-escarpe. Le fort s'élevait dans le coin nord-est de le vieille ville et bordait la mer du côté nord-est. De ce côté-là, les remparts servaient également de digue de mer. En raison de sa localisation en bord de mer, la place centrale fut surélevée de deux à trois mètres. Après la Guerre de Quatre-Vingts ans, la fortification perdit sa fonction. En 1688, il fut décidé de démolir la fortification. Dans les siècles qui suivirent, la fortification fut détruite petit à petit. Il n'en reste que très peu de traces aujourd'hui. Les fossés comblés et les remparts déblayés sont encore reconnaissables aujourd'hui sous forme de parties respectivement plus basses et plus hautes au sein de l'agglomération. Le bastion sur lequel s'élevait le moulin (encore aujourd'hui) est également aisément identifiable.
